Shy tumbuh dewasa setelah bertarung melawan “Amalareik,” yang dipimpin oleh bocah misterius bernama Stigma. Saat kembali ke Jepang, ia bertemu dengan seorang gadis bernama Ai Tennouji yang melarikan diri dari desa ninja miliknya. Ai memberi tahu Shy bahwa ia meninggalkan desa untuk mengejar salah satu anggota “Amalareik.” Sementara itu, sebuah insiden terjadi saat Tokyo tiba-tiba diselimuti bola hitam dan menghilang. Para pahlawan dikirim untuk menyelamatkan Tokyo.
(Sumber: Situs Resmi, diterjemahkan)